Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC6BQ86SZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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