Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl29Q80T74 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl29Q80T74 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl29Q80T74 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms