Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YTHDF3Q7Z739 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YTHDF3Q7Z739 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms