Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC6Q7Z403 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC6Q7Z403 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMC6Q7Z403 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms