Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD3Q7Z3D4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD3Q7Z3D4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LYSMD3Q7Z3D4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD3Q7Z3D4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LYSMD3Q7Z3D4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms