Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdc42bpbQ7TT50 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cdc42bpbQ7TT50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpbQ7TT50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms