Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec18aQ7TSQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec18aQ7TSQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec18aQ7TSQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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