Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mycbp2Q7TPH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mycbp2Q7TPH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mycbp2Q7TPH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms