Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Robo2Q7TPD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Robo2Q7TPD3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Robo2Q7TPD3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Robo2Q7TPD3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Robo2Q7TPD3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms