Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmc8Q7TN58 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc8Q7TN58 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc8Q7TN58 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms