Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCXQ7RTU7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms