Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd2Q7JJ13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd2Q7JJ13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd2Q7JJ13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd2Q7JJ13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms