Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSH2Q76I76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SSH2Q76I76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSH2Q76I76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SSH2Q76I76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SSH2Q76I76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SSH2Q76I76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SSH2Q76I76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SSH2Q76I76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SSH2Q76I76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSH2Q76I76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SSH2Q76I76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SSH2Q76I76 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SSH2Q76I76 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SSH2Q76I76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SSH2Q76I76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SSH2Q76I76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SSH2Q76I76 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SSH2Q76I76 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SSH2Q76I76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SSH2Q76I76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SSH2Q76I76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SSH2Q76I76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms