Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFVQ71UI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFVQ71UI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms