Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sned1Q70E20 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sned1Q70E20 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sned1Q70E20 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Sned1Q70E20 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sned1Q70E20 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms