Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE1Q6ZW31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE1Q6ZW31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms