Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00173Q6ZV60 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00173Q6ZV60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00173Q6ZV60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms