Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
LRRC9Q6ZRR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
LRRC9Q6ZRR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LRRC9Q6ZRR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LRRC9Q6ZRR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms