Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cand1Q6ZQ38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cand1Q6ZQ38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms