Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFXL1Q6ZNB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFXL1Q6ZNB6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFXL1Q6ZNB6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFXL1Q6ZNB6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFXL1Q6ZNB6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFXL1Q6ZNB6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms