Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMFQ6X4W1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMFQ6X4W1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSMFQ6X4W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms