Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC6Q6W4X9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC6Q6W4X9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC6Q6W4X9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms