Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD4L3Q6VB84 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L3Q6VB84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L3Q6VB84 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms