Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML4Q6UXN2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TREML4Q6UXN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREML4Q6UXN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms