Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A10Q6U841 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A10Q6U841 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC4A10Q6U841 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLC4A10Q6U841 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC4A10Q6U841 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms