Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMD1Q6SPF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD1Q6SPF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMD1Q6SPF0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms