Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5H4

POTEB, POTE ankyrin domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEBQ6S5H4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POTEBQ6S5H4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEBQ6S5H4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEBQ6S5H4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
POTEBQ6S5H4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEBQ6S5H4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEBQ6S5H4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEBQ6S5H4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms