Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APOA5Q6Q788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOA5Q6Q788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOA5Q6Q788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.5 ms