Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATAD2Q6PL18 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATAD2Q6PL18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATAD2Q6PL18 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATAD2Q6PL18 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATAD2Q6PL18 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms