Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms