Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GmipQ6PGG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GmipQ6PGG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GmipQ6PGG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms