Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB66

Lrpprc, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrpprcQ6PB66 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LrpprcQ6PB66 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
LrpprcQ6PB66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LrpprcQ6PB66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LrpprcQ6PB66 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LrpprcQ6PB66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LrpprcQ6PB66 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms