Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhb9Q6PB60 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhb9Q6PB60 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhb9Q6PB60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms