Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo4Q6PAQ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo4Q6PAQ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo4Q6PAQ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms