Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMOD2Q6P5Q4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMOD2Q6P5Q4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD2Q6P5Q4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms