Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Podnl1Q6P3Y9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podnl1Q6P3Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Podnl1Q6P3Y9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Podnl1Q6P3Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms