Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl3Q6P1Y1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl3Q6P1Y1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl3Q6P1Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms