Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3CQ6NXT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3CQ6NXT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms