Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SWSAP1Q6NVH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SWSAP1Q6NVH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SWSAP1Q6NVH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms