Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R4Q6NUP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP4R4Q6NUP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms