Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms