Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE12Q6L8Q7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE12Q6L8Q7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE12Q6L8Q7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE12Q6L8Q7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE12Q6L8Q7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE12Q6L8Q7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms