Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 27.8
NIPBLQ6KC79 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 27.8
NIPBLQ6KC79 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 27.8
NIPBLQ6KC79 LINC01606-204ENST00000519241 509 ntTSL 316.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 27.7
NIPBLQ6KC79 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 311.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 27.7
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NIPBLQ6KC79 AKR1A1-205ENST00000473038 948 ntTSL 212.33□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 27.5
NIPBLQ6KC79 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 27.5
NIPBLQ6KC79 AKR1A1-211ENST00000495913 421 ntTSL 39.6□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 27.5
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NIPBLQ6KC79 AKR1A1-210ENST00000487654 552 ntTSL 27.62□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 27.5
NIPBLQ6KC79 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 312□□□□□ -0.492e-43■■■■■ 27.5
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NIPBLQ6KC79 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 27.4
NIPBLQ6KC79 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 27.4
NIPBLQ6KC79 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 27.4
NIPBLQ6KC79 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 221.9■■□□□ 1.18e-32■■■■■ 27.1
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NIPBLQ6KC79 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 27.1
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NIPBLQ6KC79 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 26.4
NIPBLQ6KC79 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.751e-6■■■■□ 26.4
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NIPBLQ6KC79 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.942e-6■■■■□ 26.3
NIPBLQ6KC79 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 26.61□□□□□ -1.353e-6■■■■□ 26.2
NIPBLQ6KC79 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 26.2
NIPBLQ6KC79 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 26.1
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NIPBLQ6KC79 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.221e-8■■■■□ 26
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NIPBLQ6KC79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 318.93■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 518.35■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 LINC00888-201ENST00000468380 1241 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-220ENST00000588917 1087 ntTSL 216.63■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 CIRBP-208ENST00000586548 1734 ntTSL 316.12■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 25.1
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