Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYW3Q6IPR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TYW3Q6IPR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms