Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Cdk13Q69ZA1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdk13Q69ZA1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk13Q69ZA1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk13Q69ZA1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk13Q69ZA1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms