Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8eQ66JT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms