Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Npm1Q61937 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Npm1Q61937 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Npm1Q61937 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Npm1Q61937 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Npm1Q61937 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Npm1Q61937 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Npm1Q61937 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms