Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lama3Q61789 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama3Q61789 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama3Q61789 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms