Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga6Q61739 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itga6Q61739 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga6Q61739 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Itga6Q61739 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itga6Q61739 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Itga6Q61739 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Itga6Q61739 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itga6Q61739 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itga6Q61739 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itga6Q61739 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itga6Q61739 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itga6Q61739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itga6Q61739 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itga6Q61739 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Itga6Q61739 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itga6Q61739 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Itga6Q61739 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Itga6Q61739 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itga6Q61739 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms