Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim25Q61510 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim25Q61510 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms