Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd2Q61285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd2Q61285 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd2Q61285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd2Q61285 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms